مطالعه ساختاری دی پپتیدهای ser-x وx-ser با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی
پایان نامه
- دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده علوم پایه
- نویسنده سعیده صادقی
- استاد راهنما بهزاد چهکندی فرامرز طیاری
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
در این تحقیق، انرژی انواع دی پپتیدها با استفاده از محاسبات کوانتومی در سطح تئوری dft با سری پایه 6-311g** محاسبه شده است . دی پپتیدهای مورد مطالعه از اتصال آمینو اسید سرین به آمینو اسیدهای دیگر ایجاد شده اند. برای انواع دی پپتیدها و ایزومرهای ساختاری آنها انرژی، ساختار بهینه طول پیوندها، زوایای پیوندها، زوایای دای هدرال، کربن های آلفا ,و سد چرخش سرین مورد بررسی قرار گرفته شده وپایدارترین ساختار تعیین شده و علت تفاوت در پایداری دی پپتیدها مورد بررسی قرار گرفته شده است و به کمک نتایج به دست آمده نشان دادیم که دی پپتیدهای ser-x نسبت به دی پپتیدهای x-ser پایدارترند.
منابع مشابه
بررسی ساختاری و تعیین برخی توابع ترمودینامیکی کنفورمرهای مختلف تری پپتید gly-ser-gly با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی
در این تحقیق،کنفورماسیون های مدل تری پپتید gly- ser - gly که درساختار پلی پپتید مادر پروتئین فیبروئین می باشد،در اثر چرخش زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت،در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است.همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf با سری پایه(d)g31-6 وg(d, f)++311- 6 و سطح b3lyp با سری پایه(d)g31-6 انجام شده است. ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورما...
15 صفحه اولمطالعه توتومری NH2NO (H2O/NH3)n=1,2,3 در فاز گاز/حلال با استفاده از محاسبات کوانتومی
در این تحقیق تعادلات توتومری نیتروز آمین و حالت گذار حاصل از انتقال 1و3 اتم هیدروژن با استفاده از محاسبات کوآنتومی مورد بررسی قرار گرفت. تعادلات در حضور یک تا سه مولکول (آب و آمونیاک) و به صورت دیمر و تریمر نیز انجام شد. بدین منظور انرژی و ساختارهای بهینه با استفاده از نظریه تابعیت چگال با استفاده از تابعیت B3LYP و سری پایه 6-311++G(d,P) در فاز گاز بدست آمدند. توسط محاسبات فرکانسی، توابع ترمودی...
متن کاملبررسی کنفور ماسیونی دی پپتید محا فظت شده ی hco-ser-ala-nh2 با استفاده از محاسبات مکا نیک کوانتو می در فاز گازی
در این تحقیق ? کنفورماسیون های دی پپتیدhco–l-ser-l-ala–nh2و hco–d-ser-d-ala–nh2که در پروتئین های متعددی وجود دارد ? در فاز گازی مورد بررسی قرار گرفته است. محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 3 و با بهره گیری از سطح تئوری g*31-6b3lyp/انجام شده است. بدین صورت که ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورماسیون های حاصل از چرخش زاویه (c) به فواصل30 درجه از صفر درجه تا 360 درجه محاسبه شدند که سه مین...
15 صفحه اولبررسی کنفورماسیونی دی پپتید محافظت شده ی hco-cys-ala-nh2 با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در فاز گازی
در این تحقیق مقادیر انرژی، زوایای دای هدرال، نوع مهاجرت ها و تاخوردگی صورت بندی های انواع lو d دی پپتید محافظت شده سیستئین – آلانین در فاز گازی با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در سطح b3lyp و سری پایه 6-31g(d)تعیین گردید.ساختار های پایدار در حالت های متفاوت از مناطق 9 گانه ی نقشه راماچاندران بدست آمده اند. بدین ترتیب که یکی از آمینواسید ها در یک منطقه ثابت نگه داشته شده و آمینواسید دیگر در...
15 صفحه اولمطالعه توتومری nh۲no (h۲o/nh۳)n=۱,۲,۳ در فاز گاز/حلال با استفاده از محاسبات کوانتومی
در این تحقیق تعادلات توتومری نیتروز آمین و حالت گذار حاصل از انتقال 1و3 اتم هیدروژن با استفاده از محاسبات کوآنتومی مورد بررسی قرار گرفت. تعادلات در حضور یک تا سه مولکول (آب و آمونیاک) و به صورت دیمر و تریمر نیز انجام شد. بدین منظور انرژی و ساختارهای بهینه با استفاده از نظریه تابعیت چگال با استفاده از تابعیت b3lyp و سری پایه 6-311++g(d,p) در فاز گاز بدست آمدند. توسط محاسبات فرکانسی، توابع ترمودی...
متن کاملPhosphorylation of CTP Synthetase on Ser, Ser, Ser, and Ser Regulates the Levels of CTP and Phosphatidylcholine Synthesis in Saccharomyces cerevisiae*
The Saccharomyces cerevisiae URA7-encoded CTP synthetase is phosphorylated and stimulated by protein kinase C. We examined the hypothesis that Ser, Ser, Ser, and Ser, contained in a protein kinase C sequence motif in CTP synthetase, were target sites for the kinase. Synthetic peptides containing a phosphorylation motif at these serine residues served as substrates for protein kinase C in vitro....
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
دانشگاه آزاد اسلامی - دانشگاه آزاد اسلامی واحد شاهرود - دانشکده علوم پایه
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023